Лицей создан 1 сентября 1991 года.
Муниципальное общеобразовательное учреждение «Лицей №124» учрежден совместным решением комитета по управлению имуществом г. Барнаула, комитета по образованию администрации г. Барнаула, администрации Ленинского района г. Барнаула от 26.06.1996 года № 154 и зарегистрирован Постановлением администрации Ленинского района 31.07.1996 года №239/25.
Учредителем является комитет по образованию города Барнаула.
Лицей вместе с базовыми вузами: Алтайским государственным техническим университетом, Алтайским государственным университетом, Барнаульским государственным педагогическим университетом образует единый учебно-воспитательный комплекс, главной задачей которого является формирование творческой личности старшеклассника.
Лицей является учебным заведением особого типа для учащихся 7-11 классов, имеющих наклонности к физико-математическим дисциплинам, инженерно-технической и социально-экономической деятельности.
